黨政職能部門(mén)

• 黨委辦公室、校長(cháng)辦公室

• 校友會(huì )辦公室

• 紀委、監察專(zhuān)員辦公室

• 黨委組織部（人才辦）
  黨校、機關(guān)黨委

• 黨委宣傳部（意識形態(tài)工作領(lǐng)導小組辦公室）

• 黨委統戰部

• 黨委學(xué)生工作部（學(xué)生處）、學(xué)生就業(yè)指導服務(wù)中心

• 團委

• 工會(huì )

• 黨委教師工作部、人事處（名醫管理辦公室）

• 教務(wù)處

• 研究生院（學(xué)位辦公室）

• 學(xué)科建設辦公室

• 科技處（學(xué)術(shù)委員會(huì )辦公室）
  科技成果轉移轉化中心

• 發(fā)展規劃處

• 國際合作交流處、對外合作發(fā)展辦公室、港澳臺事務(wù)辦公室

• 信息化建設管理處（網(wǎng)絡(luò )安全和信息化領(lǐng)導小組辦公室）

• 計劃財務(wù)處

• 醫院管理處

• 審計處

• 后勤保障處

• 保衛處（武裝部）

• 國有資產(chǎn)管理處
  采購招標管理辦公室

• 基建處

• 離退休工作處

直屬單位

• 教師發(fā)展中心

• 高教研究中心、教學(xué)質(zhì)量監控與評價(jià)中心

• 圖書(shū)館

• 雜志社

• 制藥廠(chǎng)

• 陜西中醫藥博物館

教學(xué)科研單位

• 馬克思主義學(xué)院

• 體育部

• 基礎醫學(xué)院

• 第一臨床醫學(xué)院
  中醫系

• 第一臨床醫學(xué)院
  中西醫臨床醫學(xué)系

• 第二臨床醫學(xué)院
  臨床醫學(xué)系

• 藥學(xué)院

• 針灸推拿學(xué)院

• 醫學(xué)技術(shù)學(xué)院

• 護理學(xué)院

• 公共衛生學(xué)院

• 人文管理學(xué)院

• 外語(yǔ)學(xué)院

• 國際教育學(xué)院

• 繼續教育學(xué)院

• 陜西中藥資源產(chǎn)業(yè)化省部
  共建協(xié)同創(chuàng )新中心

• 醫學(xué)科研實(shí)驗中心

• 張學(xué)文國醫大師工作站

• 郭誠杰?chē)t大師工作站

附屬醫院

• 陜西中醫藥大學(xué)
  附屬醫院

• 陜西中醫藥大學(xué)
  第二附屬醫院